（記者王瀟雨）近日，國際期刊《細胞通訊》在線發(fā)表了來自中國科學(xué)院動物研究所劉峰團隊及其合作者的論文。他們以斑馬魚尾部造血組織為研究對象，利用多重轉(zhuǎn)錄組測序，繪制了擴增性造血器官的3D轉(zhuǎn)錄組圖譜，闡釋了造血干細胞和微環(huán)境細胞之間的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，為造血干細胞擴增的機制研究提供了更多啟示。

研究人員之所以選擇斑馬魚尾部造血組織為解析對象，是由于其在功能上類似于哺乳動物的胎肝。他們采用了3種轉(zhuǎn)錄組測序方法，即特定類型群體細胞轉(zhuǎn)錄組、空間轉(zhuǎn)錄組和單細胞轉(zhuǎn)錄組，詳細解析了斑馬魚尾部造血組織的時空特性。

具體來說，空間轉(zhuǎn)錄組測序反映細胞位置信息，揭示了多種微環(huán)境因素對造血干細胞的不同調(diào)控方式，并實現(xiàn)了三維轉(zhuǎn)錄組重構(gòu)斑馬魚造血器官；單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)更精細地闡釋了尾部造血組織細胞類群、細胞特征及細胞間分子調(diào)控，并發(fā)現(xiàn)造血干祖細胞分化和細胞周期存在一定的關(guān)聯(lián)性。同時，多重轉(zhuǎn)錄組測序綜合分析揭示了造血干細胞在尾部造血組織的擴增受到內(nèi)源性和外源性信號的共同調(diào)控，鑒定了新的造血干細胞的標(biāo)記基因，發(fā)現(xiàn)了影響造血干細胞擴增的信號通路，完善了造血干細胞—微環(huán)境細胞間分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

此外，研究團隊構(gòu)建了斑馬魚尾部造血組織多重轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫，可檢索特定基因在造血組織的表達譜，包括基因表達的時間、細胞類型及相對空間位置。