SADS冠狀病毒導(dǎo)致疫情

基于SADS是一種未知病毒引起的新疫情這點(diǎn)假設(shè)，研究團(tuán)隊(duì)開始正式解謎。

研究團(tuán)隊(duì)從患病仔豬小腸中收集樣本，用高通量測序技術(shù)來進(jìn)行宏基因組學(xué)分析。最終發(fā)現(xiàn)，SADS冠狀病毒和蝙蝠冠狀病毒HKU2序列匹配。通過重新組裝，研究團(tuán)隊(duì)獲得了27173bp的SADS冠狀病毒基因，和HKU2冠狀病毒有95%的序列一致性。HKU2首先發(fā)現(xiàn)于在香港和廣東的中華菊頭蝠中。

研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)，在4個(gè)養(yǎng)豬場的急性病仔豬和母豬身上均檢測到了SADS冠狀病毒，在恢復(fù)或健康的豬身上則沒有，在附近沒有SADS跡象的養(yǎng)豬場里也沒有檢測到。

回顧性PCR分析顯示，在PEDV爆發(fā)的時(shí)候，A農(nóng)場里還同時(shí)存在SADS冠狀病毒，該農(nóng)場里于2016年12月提取的第一個(gè)樣本表現(xiàn)出SADS冠狀病毒強(qiáng)陽性。但從2017年1月中旬開始，SADS冠狀病毒成為了病豬里檢測到的主要病毒。

研究團(tuán)隊(duì)認(rèn)為，在PEDV感染完全檢測不到后出現(xiàn)了仔豬的大規(guī)模死亡這一事實(shí)，暗示是SADS冠狀病毒引起了豬的致命感染，是那些大規(guī)模疫情爆發(fā)的真正原因，PEDV則不是直接因素。

在SADS爆發(fā)高峰期、以及爆發(fā)后期，4個(gè)養(yǎng)豬場里都沒有檢測到PEDV和其他一直的豬腹瀉病毒的存在，這些都支持了上述結(jié)論。

來源于菊頭蝠

值得注意的是，盡管如前所述，SADS冠狀病毒和 HKU2冠狀病毒全基因組的一致性達(dá)到95%，但刺突蛋白基因序列的一致性僅86%。

刺突蛋白是什么？周鵬對(duì)澎湃新聞解釋，“冠狀病毒都是用刺突蛋白來入侵細(xì)胞，就像‘鑰匙’和‘鎖’一樣，它依賴于刺突蛋白和細(xì)胞表面的受體結(jié)合，然后才能進(jìn)入細(xì)胞，成功感染，但如果這個(gè)刺突蛋白變異很大的話，它就不能利用受體了?！?/p>

周鵬強(qiáng)調(diào)，“基于這樣的原因， 86%一致性這樣的數(shù)據(jù)，我們認(rèn)為SADS冠狀病毒和 HKU2冠狀病毒關(guān)系還不是最直接的。我們之前有做SARS經(jīng)驗(yàn)，最終發(fā)現(xiàn)跟SARS的刺突蛋白一致性達(dá)到97%、98%這個(gè)樣子，才能夠直接利用人的受體，感染成功?！?/p>

基于這個(gè)理論，研究團(tuán)隊(duì)繼續(xù)找其他來源于蝙蝠的冠狀病毒。

研究團(tuán)隊(duì)隨后篩選了團(tuán)隊(duì)在2013年至2016年從廣東省的7個(gè)不同地點(diǎn)采集的591個(gè)蝙蝠肛門拭子。肛門拭子即用棉簽在蝙蝠的肛門處掏一下，而取樣時(shí)間則一般在每年的春季和秋季。

團(tuán)隊(duì)篩選后發(fā)現(xiàn)，58(9.8%)個(gè)蝙蝠肛門拭子樣本顯示出陽性，且都來源于中華菊頭蝠。菊頭蝠因有結(jié)構(gòu)復(fù)雜的馬蹄形鼻葉而得名，也是SARS等許多動(dòng)物源病毒的重要宿主。

高通量測序則得出，這種來源于中華菊頭蝠中的冠狀病毒(暫時(shí)稱“SADSr冠狀病毒”)和SADS冠狀病毒在大小(27.2kb)上近似，總體序列一致性在96%-98%之間。

更重要的是，兩者刺突蛋白(樣本分別為162149和141388)的序列一致性超過了98%。

周鵬提到，“我們目前的結(jié)論是，后來在蝙蝠中發(fā)現(xiàn)SADSr冠狀病毒可能是病豬中發(fā)現(xiàn)的這個(gè)新病毒SADS冠狀病毒的祖先，但同樣直接來源于蝙蝠中的HKU2冠狀病毒和SADSr冠狀病毒可能來源于一個(gè)祖先?！?/p>

石正麗還提到，團(tuán)隊(duì)在豬場周圍確實(shí)發(fā)現(xiàn)，有蝙蝠在豬場周圍飛翔?！斑@些豬場感覺是比較新建的，它的位置是在城外，旁邊就是一個(gè)小山丘，我們認(rèn)為這個(gè)小山丘附近是有蝙蝠棲息地的。所以很明顯這個(gè)傳播途徑就是通過糞便污染豬場的環(huán)境，最后污染到豬?！?/p>

不過，周鵬同時(shí)提到，“盡管我們認(rèn)為SADS冠狀病毒是一種完全新型的病毒，但現(xiàn)在有一個(gè)困難是我們還沒有鑒定出這種新型蛋白它的受體是什么，所以還不好這樣說?！?/p>