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滅絕物種RNA首次分離測(cè)序,為復(fù)活物種或研究RNA病毒開(kāi)創(chuàng)新方向
瑞典國(guó)家分子生物科學(xué)中心科學(xué)家首次分離和測(cè)序了一個(gè)已滅絕物種的RNA分子,從而重建了該滅絕物種(塔斯馬尼亞虎)的皮膚和骨骼肌轉(zhuǎn)錄組。該項(xiàng)成果對(duì)復(fù)活塔斯馬尼亞虎和毛猛犸象等滅絕物種,以及研究如新冠病毒等RNA病毒具有重要意義。相關(guān)論文刊發(fā)于最新一期《基因組研究》雜志。
研究中使用的塔斯馬尼亞虎標(biāo)本,在室溫下干燥保存于瑞典國(guó)家歷史博物館。圖片來(lái)源:《基因組研究》
塔斯馬尼亞虎,也稱為袋狼,是一種頂級(jí)食肉有袋動(dòng)物,曾經(jīng)漫步在澳大利亞大陸和塔斯馬尼亞島,最后一只塔斯馬尼亞虎于1936年在塔斯馬尼亞州博馬里斯動(dòng)物園死亡,自此該物種宣告滅絕。
研究人員指出,重建一只功能性的活塔斯馬尼亞虎不僅需要對(duì)其基因組(DNA)有全面了解,還需要對(duì)組織特異性基因表達(dá)動(dòng)力學(xué)和基因調(diào)控如何發(fā)揮作用有全面的認(rèn)識(shí),而這些只有通過(guò)研究其轉(zhuǎn)錄組(RNA)才能實(shí)現(xiàn)。
在最新研究中,研究人員首次對(duì)瑞典自然歷史博物館保存的一只130年前的干燥塔斯馬尼亞虎標(biāo)本的皮膚和骨骼肌組織轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了測(cè)序,從而鑒定出了這個(gè)物種的組織特異性基因表達(dá)特征。獲取的轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量非常好,研究人員識(shí)別出其肌肉和皮膚特異性蛋白質(zhì)編碼RNA,并對(duì)缺失的核糖體RNA和微小RNA基因進(jìn)行了注釋。
這項(xiàng)開(kāi)創(chuàng)性研究第一次檢測(cè)到了一個(gè)多世紀(jì)前滅絕的袋狼特異性調(diào)控基因(如微小RNA),為探索儲(chǔ)存在全球博物館的大量標(biāo)本和組織開(kāi)辟了新機(jī)會(huì),那里有很多RNA分子等待被發(fā)現(xiàn)和測(cè)序。未來(lái)人們不僅可從滅絕動(dòng)物身上獲取RNA,還可從博物館收藏的蝙蝠和其他宿主生物的皮膚上獲取新冠病毒等RNA病毒基因組及其進(jìn)化前體。
編輯:馬嘉悅