孫中山先生由于長(zhǎng)期為中國(guó)革命奔波，積勞成疾，身患肝病。馮玉祥北京政變成功后，中山先生應(yīng)邀北上共商大計(jì)。1924年底北上之初，身體已有不適，到天津時(shí)肝病復(fù)發(fā)。進(jìn)京后，病情危重，1925年1月26日施行手術(shù)時(shí)，醫(yī)生斷定為肝癌。在京國(guó)民黨人意識(shí)到情況嚴(yán)重，當(dāng)晚即開政治委員會(huì)議商量。1925年2月16日，在京國(guó)民黨中央委員在北京飯店開會(huì)，“討論先生身后準(zhǔn)備事宜。到會(huì)者除政治委員外，有孫中山先生家屬孫哲生、孔庸之、宋子文等。決議附身事由家屬主持而由黨襄助之，其他典禮則由家屬與黨分別主辦，墓道擬在北京或郊外”。

1925年3月12日上午9時(shí)30分，中山先生在北京鐵獅子胡同行轅逝世，遺體送北京協(xié)和醫(yī)院施行防腐處理。中山先生逝世后，國(guó)民黨立即向海內(nèi)外發(fā)出訃告，并迅速組建治喪機(jī)構(gòu)，分頭操辦。在北京，于逝世當(dāng)晚組織“孫中山先生治喪辦事處”，以經(jīng)紀(jì)其事。治喪的主要決策由北京治喪處會(huì)同孫中山家屬共同做出。

逝世第二天，國(guó)民黨人與蘇聯(lián)政府聯(lián)系，定制安葬列寧所用玻璃蓋鋼棺。但制作運(yùn)輸尚需時(shí)日，于是先使用協(xié)和醫(yī)院舊存的一具美式楠木棺，棺的頂面為玻璃，吊唁者可瞻仰遺容。中山先生逝世后，前來(lái)吊唁的有俄、美、德、法、比、英、日、荷、丹麥、瑞典、葡萄牙等國(guó)公使的代表，參議院非常國(guó)會(huì)、各社會(huì)團(tuán)體及梁?jiǎn)⒊⒍戊魅?、黃郛、楊度、馮玉樣、張作霖、盧永樣、唐紹儀等均來(lái)電吊唁，并派專員來(lái)京協(xié)助辦理喪事。

治喪處決定1925年3月19日為大殮期，并致書于執(zhí)政府，“茲定于三月十九日上午十一時(shí)敬迎孫中山先生靈柩，由協(xié)和醫(yī)院禮堂至中央公園內(nèi)社稷壇大殿安放，并于二十四日舉行弔（吊）禮”。1925年3月18日上午10時(shí)，中山先生的家族葬禮在北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院禮拜堂進(jìn)行。宋慶齡和孫科邀請(qǐng)了與他們一向交誼很好的燕京大學(xué)教授劉廷芳主持，圣公會(huì)牧師朱友漁協(xié)助主持。參加葬禮者約400人，除親屬孔祥熙、宋子文外，還包括國(guó)民黨要員。

19日11時(shí)，孫中山靈柩奉移至中央公園，12時(shí)一刻，抵社稷壇大殿。移靈過(guò)程中，12萬(wàn)民眾自發(fā)地護(hù)送。自3月20日起，國(guó)民黨、北京市各界人士、來(lái)自全國(guó)各地的民眾開始在社稷壇“拜殿”祭奠孫中山。22日，治喪處定于“4月2日午前11時(shí)恭送先生靈柩于西山暫厝，俟紫金山墓地建筑完竣后再行護(hù)運(yùn)”。北京政府亦派出柏文蔚及內(nèi)務(wù)次長(zhǎng)王耒為治喪政府代表，協(xié)助辦理喪事。在中共方面，李大釗、鄧穎超也參加了北京治喪處的工作。

3月24日至4月1日為各界公祭日，每天都有成千上萬(wàn)的各界人士前來(lái)中央公園吊唁。3月30日，蘇聯(lián)政府特派專員多米諾夫?qū)①?zèng)送的玻璃蓋鋼棺運(yùn)到北京，但此棺“外觀頗佳，但質(zhì)地極薄，恐不耐久”，不利于長(zhǎng)期存放遺體，最后決定仍用原棺。

4月2日下午，孫中山的靈柩出中央公園，經(jīng)北京長(zhǎng)安街、西單、西直門，移往西山碧云寺暫厝，安放于碧云寺金剛寶座塔石龕內(nèi)，30萬(wàn)群眾自發(fā)送行。

此后的幾年間，孫中山先生靈柩只有廣東革命政府所派的少數(shù)衛(wèi)士守護(hù)。由于戰(zhàn)火頻繁，守靈處主任李榮為了保護(hù)中山先生遺體，決定和衛(wèi)士們一起把孫中山遺體轉(zhuǎn)移到附近一個(gè)山洞里。他向協(xié)和醫(yī)院的潘醫(yī)生要了一些防腐藥水，又從中法中學(xué)取回了孫中山最初曾用的一具美式小棺，1927年11月25日深夜兩點(diǎn)半，李榮召集全體守靈衛(wèi)士把中山先生遺體從楠木大棺中取出，用藥棉裹好，然后移入美式小棺中，放置于山洞里隱藏起來(lái)。直到1928年南京國(guó)民政府發(fā)動(dòng)二次北伐占領(lǐng)北京后，守靈衛(wèi)士才于6月7日夜間，把中山先生遺體從山洞取回，重新?lián)Q入大棺，放回碧云寺靈堂中。但另有說(shuō)法認(rèn)為，“移靈”一說(shuō)也許是守靈衛(wèi)士無(wú)奈之中想出的計(jì)策：故意散布傳言，讓人以為孫中山先生的遺體已經(jīng)不在碧云寺了，以此轉(zhuǎn)移圖謀不軌者的視線。

1928年7月6日，蔣介石和閻錫山、馮玉祥、李宗仁、白崇禧及吳稚暉等至北京西山碧云寺中山先生靈前舉行祭告典禮，以示北伐勝利。12月20日，南京國(guó)民政府特派林森、鄭洪年、吳鐵城赴北京，此前定制的美式銅棺也隨車運(yùn)往北京。1929年1月，林森展開工作，派員訓(xùn)練杠夫、拓寬大道。

1929年5月，南京中山陵竣工。5月22日至23日，碧云寺舉行隆重的遺體改殮儀式。5月25日晚，宋慶齡、孫科等親屬與林森、鄭洪年、吳鐵城及海陸空軍總司令行營(yíng)主任何成浚，河北省主席、代理平津衛(wèi)戍司令商震先后都抵達(dá)碧云寺。第二天移靈時(shí)，遺體從楠木棺內(nèi)移至歐式銅棺中。移靈前政府要員孔祥熙登塔巡視，發(fā)現(xiàn)當(dāng)年經(jīng)孫中山扶植過(guò)的“九龍柏”青翠茂盛，興奮之余特撰寫“總理親手扶植塔頂側(cè)柏記”，以示紀(jì)念。

孫中山換下來(lái)的民國(guó)大禮服、大禮帽等衣冠，仍放在原來(lái)的楠木棺內(nèi)封存在石塔中——花崗巖砌筑的墓墻上鑲嵌著漢白玉雕琢的墓碑，上面鐫刻著“孫中山先生衣冠?！卑藗€(gè)大字，作為孫中山靈樞暫厝碧云寺的紀(jì)念。

5月26日下午3時(shí)，中山先生靈柩途經(jīng)長(zhǎng)安門、中華門，出正陽(yáng)門抵東車站，移靈專列離開火車站，開往南京中山陵。